Arrivé au Sénat avec ses partisans, Palpatine déclare qu'il est temps de mettre fin à ces temps troublé et incertain. L'Ordre Jedi devenu indigne de confiance - lui-même ayant été victime d'un attentat - il faut se détacher de ce que la République a fondé et ce qui a finalement causé sa chute. Grâce à l'influence du mouvement anti-Jedi, Palpatine déclare qu'il faut un Ordre désormais plus fort pour survivre à la chute des Jedi et aux temps à venir. Il se déclare Empereur de la galaxie et annonce l'Empire comme nouveau régime. La plupart des sénateurs suivent Palpatine dans son idéal. Pourtant, quelques sénateurs restés de côté, comme Bail Organa, inquiet de la tournure que prend les événements.
Ils ne sont pas prêts d'accepter cette prise de pouvoir du tyran. L'Empereur met alors en route sa plus grande traîtrise. Avant de partir, il met en place son dernier plan.
Palpatine : "Tous les Jedi sont maintenant des ennemis de la République."
Il envoie Skywalker et les troupes de choc de l'Empire prendre d'assaut le Temple Jedi et massacrer ses occupants. Après avoir envoyé un message pour un rapatriement massif des Jedi au Temple, Anakin pénètre à l'intérieur de celui-ci et assassine tout opposant à sa marche. Dans le couloir principal du Temple, il attaque les jeunes Padawans Jedi qui malgré la défense ardue des maîtres présents et des jeunes chevaliers. Titi Jukassa est un jeune Jedi qui combat lors du raid de la République sur le Temple Jedi, ainsi que le jeune Tado ou encore Bene. Ces derniers ne survivront pas. Cette scène sera enregistrée par les caméras de surveillance du Temple. Quasiment tous les Jedi sont morts. Padmé Amidala a eu vent des massacres qui se sont produits sur Coruscant: elle rassemble autour d'elle des opposants à l'Ordre Nouveau qui s'en vont discuter dans ses appartements; plusieurs discours dans des lieux variés se suivront alors. Bail Organa et Mon Mothma poseront les prémices de la Rébellion. D'autres sénateurs de leurs avis (Jar Jar Binks par exemple) les soutiendront. Il est vraisemblable que Palpatine ait vent de ces agissements. Mais il a d'autres plans pour le moment.
Entre-temps, beaucoup de choses se sont passés du côté des Jedi restant. En traquant Grievous, Obi-Wan est confronté à deux de ses gardes du corps, des droïdes MagnaGuard, qu'il arrive à battre. En surveillant le général, il arrive dans une grotte où vivent de grands lézards. Grievous vient de se faire "opérer" par la société médicale d'Utapau et on apprend que c'est à cet endroit qu'il fut créé (il est né sur une autre planète, Kaleesh selon l'UE.) C'est à cet endroit que nous apprenons une certaine procédure médicale qui sera utilisé à la fin du film. Il fini par être repéré par le général. Quand il voit que Grievous part sur son transport personnel -une machine composée d'un canon et d'une roue crantée posés sur quatre pattes- Obi-Wan décide de chevaucher un des lézards, un Boga, vivant avec les Monstres Nos, pour le rattraper. La course poursuite sur le sol rocailleux de la planète commence. Au bout d'un moment, la situation s'inverse et Obi-Wan doit se réfugier dans une grotte où il est poursuivit par le Général dont la machine a la capacité de s'agripper aux murs et au plafond. Ce dernier descend de son véhicule et décide d'affronter le Jedi en duel.
En plein combat, les bras de Grievous se séparent en deux, ce qui lui permet de manipuler quatre sabres laser. Pourtant cela ne lui servira pas à grand chose. À la fin du combat, Obi-Wan utilisera un blaster pour anéantir le général. Ce dernier s'effondrera. On aura alors le loisir d'observer son véritable visage d�extra-terrestre avant de voir ses yeux se révulser. Obi-Wan décide de repartir. Il ne connaît pas encore les terribles événements qui se sont produits en son absence... C'est Bail Organa qui découvre le premier ce qu'il s'est passé au Temple, et ainsi se heurte-t-il déjà à la haine de Palpatine. Il voit le corps inanimé d'un jeune Jedi dans le hangar du Temple, avec un clone à ses côtés. Le clone lui prétend que les Jedi sont désormais tous des ennemis.
